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首頁 > 產品中心> 檢測試劑> DNA檢測> ThruPLEX® Plasma-seqRubiconGenomics 測序試劑盒
RubiconGenomics 測序試劑盒

簡要描述:RubiconGenomics ThruPLEX Plasma測序試劑盒
1、為無細胞DNA設計---新配制的修復和連接試劑。
2、高性能的NGS文庫---文庫多樣性,樣本輸入量少,有更寬的和可重復的GC覆蓋范圍。
3、適應的樣本輸入量--<1-30mg的無細胞的DNA.
快速便捷的操作---在單個管或孔中,三步完成,2個小時,無需純化或者樣本轉移步驟。

  • 產品型號:ThruPLEX® Plasma-seq
  • 廠商性質:生產廠家
  • 更新時間:2023-07-31
  • 訪  問  量:3283
詳細介紹
品牌corning/美國產地類別進口
應用領域醫(yī)療衛(wèi)生,生物產業(yè)

RubiconGenomics ThruPLEX Plasma測序試劑盒

ThruPLEX® Plasma-seq Kit

Illumina® NGS library preparation for cell-free DNA

用于無細胞DNA的Illumina NGS制備

RubiconGenomics ThruPLEX Plasma測序試劑盒

  1. 為無細胞DNA設計---新配制的修復和連接試劑。

  2. 高性能的NGS文庫---文庫多樣性,樣本輸入量少,有更寬的和可重復的GC覆蓋范圍。

  3. 適應的樣本輸入量--<1-30mg的無細胞的DNA.

快速便捷的操作---在單個管或孔中,三步完成,2個小時,無需純化或者樣本轉移步驟。

美國Rubicon Genomics R30050   PicoPLEX:trademark: WGA kit    50 rxn  現貨供應
美國Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn  現貨供應
美國Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn  現貨供應

紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司將一如既往的為您提供高品質的:IPS/ES干細胞、試管嬰兒、再生醫(yī)學、細胞治療、組織器官再生、生物樣本處理、細胞培養(yǎng)等產品。


多樣性zui高,zui少的未映射的無細胞DNA讀取

優(yōu)秀的靶向序列捕獲Peformance

重現性好,無偏GC覆蓋

卡羅林斯卡研究所CRUK評估

ThruPLEX等離子-SEQ套件單管工作流程


多樣性zui高,zui少的未映射的無細胞DNA讀取


具有很高的多樣性和低數量的重復和未映射ThruPLEX等離子-SEQ套件產生質量庫讀取。無細胞DNA從3血漿樣品中提取,并在如由Qubit®測定中所示的量制備的庫。 mononucleosomal的DNA各樣品中作為由Bioanalyzer®測量的量對應于0.09納克,0.62納克,和15.44毫微克。匯集庫進行測序上的IlluminaNextSeq®500與17M 25M到一個配對末端運行每個庫讀取,復制計算率后的數據降采樣,以17米每庫讀取。


優(yōu)秀的靶向序列捕獲Peformance


ThruPLEX等離子體SEQ套件文庫以高效率捕獲并與激酶組用于突變檢測的深覆蓋所產生的數據。在5毫微克,6.5納克,一式三份10毫微克的操作量從3血漿樣品制備的庫,和有針對性的測序使用與ClearSeq人類DNA激酶組小組SureSelectXT2豐富的樣品進行了上Illumina的MiSeq。平均而言,5M分別讀取每個庫生成的。選擇的基地被成功抓獲那名中或毒餌250 bp的內基地

美國Rubicon Genomics R30050   PicoPLEX:trademark: WGA kit    50 rxn  現貨供應
美國Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn  現貨供應
美國Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn  現貨供應

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重現性好,無偏GC覆蓋


ThruPLEX等離子-SEQ套件在整個人類基因組提供了zui可重復的和公正的GC覆蓋。 ThruPLEX庫顯示zui小變異橫跨9個人的血漿樣本進行測試。文庫從1毫升血漿樣品的分離和測序上的Illumina NextSeq 500四個單獨的血漿樣品無細胞的DNA制備的用于構建NEBNext超庫。



卡羅林斯卡研究所CRUK評估


Illumina公司NGS庫用5納克使用ThruPLEX等離子體SEQ套件收集的血漿樣品中分離的無細胞的DNA的制備。低通WGS是在HiSeq進行大約12.5M每個庫的讀取。 (Karolinska研究所,瑞典的數據提供)。


ThruPLEX等離子-SEQ套件單管工作流程

ThruPLEX等離子-SEQ套件單管工作流程


1至30毫微克無細胞DNA的開始,ThruPLEX等離子-SEQ套件創(chuàng)建了3個簡單的步驟索引庫:末端修復,接頭連接,以及高保真庫放大。不需要凈化或樣品轉移步驟。流線型的工作流程在2個小時的單管或表現良好,防止樣品的損失,提高陽性樣品鑒定。


ThruPLEX等離子-SEQ套件技術

ThruPLEX等離子-SEQ套件技術


ThruPLEX等離子體SEQ套件技術是為無細胞的DNA進行了優(yōu)化的3步反應。無細胞的DNA(1ng至30毫微克)首先在一高效率的處理修復。背景是使用無單鏈尾雙鏈適配器減小。平端連接具有高效率的發(fā)生。阻止5'端減少適配器適配器連接。背景由結扎后破壞未使用的適配器進一步降低。高保真擴增完成反應,生成索引Illumina的圖書館。


Ordering Information

CAT. NO. R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S  Kit (12 reactions, 12 single indexes)

CAT. NO. R400491 ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit (48 reactions, 48 single indexes)

CAT. NO. R400492 ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit (96 reactions, 96 dual indexes)

美國Rubicon Genomics R30050   PicoPLEX:trademark: WGA kit    50 rxn  現貨供應
美國Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn  現貨供應
美國Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn  現貨供應

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設計用于無細胞的DNA:新制定維修和連接試劑具有優(yōu)化的協(xié)議

高性能NGS庫:具有廣泛和可重復的GC覆蓋高度多樣性

可變采樣輸入:<1毫微克至30毫微克無細胞的DNA

快速簡單的工作流程:在單管3步,或同時在2個小時,沒有凈化或樣品轉移步驟

研究應用:從庫樣本,其中結果需要高靈敏度,包括液體活檢,葉綠體DNA,并有針對性測序

自動化友好:Beckman®FXP工作站

在恒溫冷凍保證了9個月,在-20℃。


儲存于-20℃。


常見問題解答

1.什么類型的樣品和投入可以用等離子ThruPLEX-SEQ使用?

ThruPLEX等離子體SEQ套件被設計為從血漿中分離的無細胞的DNA產生的Illumina NGS DNA文庫。所述ThruPLEX等離子體SEQ化學被改寫,以產生多樣庫具有廣泛的GC覆蓋,從無細胞的DNA的1至30毫微克*提供重現的測序結果。

應用程序的輸入樣本類型推薦的輸入量

從等離子和液體活檢DNA測序;葉綠體DNA分析,從血漿中1納克孤立的目標序列無細胞DNA - 30納克*

*庫已經從輸入產生量低于1納克和超過30納克。

以獲取進一步的信息。

2.什么是ThruPLEX的DNA序列套件和新ThruPLEX等離子體序列包之間的主要技術差異?

ThruPLEX等離子體SEQ套件已經用于從血漿中分離無細胞的DNA進行了優(yōu)化。

剪切或無細胞的DNA片段化是沒有必要與ThruPLEX等離子體以次套件。

的協(xié)議是不同的(見下文)。

3.什么是ThruPLEX等離子體序列和ThruPLEX的DNA序列之間的協(xié)議差異?

模板制備步驟:卷和保溫溫度

庫合成步驟:卷和孵化溫度

庫擴增步驟:卷和擴增循環(huán)數

4.可從血漿ThruPLEX-SEQ試劑與ThruPLEX的DNA序列試劑互換?

不,ThruPLEX等離子-SEQ套件內容不與其他人Rubicon基因組學產品互換。

美國Rubicon Genomics R30050   PicoPLEX:trademark: WGA kit    50 rxn  現貨供應
美國Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn  現貨供應
美國Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn  現貨供應

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5.什么索引類型或條形碼,你有可用?

ThruPLEX等離子體SEQ 12S和48S套件中提供的管分配Illumina的兼容8NT單個索引或96孔板中。這些指數序列是由威康信托基金會桑格研究所在英國劍橋的發(fā)展。關于桑格指數序列的信息可以在自然的方法可以找到7,111-118(2010)。

ThruPLEX等離子體SEQ 96D套件設置有Illumina公司TruSeq HT i5和在96孔板分配i7雙索引。在i5指標有Illumina的D501 D508到序列,和I7指標有D701到D712序列。

有關索引的詳細信息,請參閱附錄1的等離子ThruPLEX-SEQ套件說明手冊中的

6.你對隔離血漿中游離DNA有什么建議?

ThruPLEX等離子序列與游離DNA進行了優(yōu)化使用循環(huán)QIAamp®核酸試劑盒(Qiagen,目錄55114號)編制。

Tris和EDTA的在包含輸入DNA中的緩沖器中的濃度必須不超過10毫和0.1mM分別。避免含磷酸鹽緩沖液。

7.什么樣的收集管我應該用從受試者抽血?

在盧比肯基因組學科研人員使用與K2 EDTA真空管靜脈管采集的血液(Becton Dickinson公司,貨號36643)。


9.從尿或其他生物液體隔離式CAN細胞游離DNA與ThruPLEX等離子-SEQ套件使用?

ThruPLEX等離子體以次用從人血漿中分離無細胞的DNA進行了優(yōu)化;然而,該試劑盒可以與來自其他生物流體降解的DNA的工作。從其它樣品來源無細胞的DNA必須首先用DNA提取/純化試劑盒提取。由于這些來源的游離DNA正常降解/零散,不成附加是不必要的。每個反應輸入無細胞DNA的量必須不超過10微升。

10.與任何靶向序列捕獲系統(tǒng)兼容ThruPLEX等離子-SEQ套件?

是的,ThruPLEX等離子-SEQ套件與各大外顯子組和靶向富集產品,包括安捷倫SureSelect®,羅氏NimbleGen®SeqCap®EZ和自定義面板兼容。 

美國Rubicon Genomics R30050   PicoPLEX:trademark: WGA kit    50 rxn  現貨供應
美國Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn  現貨供應
美國Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn  現貨供應

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